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狹義的生物肥料，即指微生物(細菌)肥料，簡稱菌肥，又稱微生物接種劑。是由具有特殊性能的微生物經過發酵(人工培制)而成的，含有大量有益微生物，施人土壤后，或能固定空氣中的氮素，或能活化土壤中的養分，改善植物的營養環境，或在微生物的生命活動過程中，產生活性物質，刺激植物生長的特定微生物制品。

廣義的生物肥料泛指利用生物技術制造的、對作物具有特定肥（或有肥效又有刺激作用）的生物制劑，其有效成分可以是特定的活生物體、生物體的代謝物或基質的轉化物等，這種生物體既可以是微生物，也可以是動、植物組織和細胞。從現代農業生產中倡導的綠色農業、生態農業的發展趨勢看，不污染環境的無公害生物肥料，必將會在未來農業生產中發揮重要作用。（百科）